Le bâtiment de l'école Paul Cézanne était à l'origine l'école de garçons de Chantilly (l'école des filles étant l'actuelle Médiathèque).

En 1888 une classe de filles est autorisée dans les locaux de l'école des garçons.

L'école a été nommée en mémoire du peintre Paul Cézanne (1839-1906) qui résida plusieurs mois durant l'été 1888 à Chantilly et y réalisa des huiles nommées "Une Allée à Chantilly" aujourd'hui exposées à Londres (National Gallery).